Ngày 14 tháng 5 năm 2018, Bộ Tài chính ban hành công văn số 5537/BTC-CST hướng dẫn đối với hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu rồi xuất khẩu. Theo đó:
- Từ ngày 01/07/2016 đến trước ngày 01/02/2018, theo quy định tại khoản 6 Điều 1 Nghị định số 100/2016/NĐ-CP, cơ sở kinh doanh không được hoàn thuế đối với trường hợp hàng nhập khẩu sau đó xuất khẩu.
- Từ ngày 01/02/2018, cơ sở kinh doanh có hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu bao gồm cả trường hợp: hàng hóa nhập khẩu sau đó xuất khẩu vào khu phi thuế quan, hàng hóa nhập khẩu sau đó xuất khẩu ra nước ngoài được xét hoàn thuế giá trị gia tăng theo hướng dẫn tại khoản 2 Điều 1 Nghị định số 146/2017/NĐ-CP.